clustal（clustal结果文件格式特点）
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clustal结果文件格式特点
clustal结果文件格式特点是输入序列的格式的文件非常灵活。可以是FASTA格式，也可以是GDE,PIR,RSF，GCG/MSF等格式。输出格式也非常的灵活，能够是ALN,GCG,PHYLIP,NEXUS等格式。它能够有两种工作模式，多序列对比工作模式，剖面对比模式。将待研究序列加入到一组与之同源，但来自不同物种的序列中进行多序列同时比较，以确定该序列与其它序列间的同源性大小。这是理论分析方法中最关键的一步。完成这一工作必须使用多序列比较算法，非常方便。
如何往clustal中加入序列
新建一个记事本
然后输入一下内容，保存，在clustalX中导入就行了
》NM_146120.3
*********序列名称编号信息，按自己需要命名就行了**********
1
gcagcctggg
tcctcaccgt
cgccatggct
ccgtaccgct
cttcactgct
ctgcgcgctg
61
ctcctcctgg
cgctgtgcgc
actgtcgcct
tcccatgcag
ccaccacatc
acggggcagg
121
gcccaagaga
gggcgcccca
aagtcgggtg
tctgaggcgc
ggcccagcac
tatggtggtg
181
gagcaccccg
aattcctgaa
ggcagggaag
gagcctggcc
tgcagatctg
gcgtgtggag
241
aagtttgacc
tggtgcctgt
gccccccaac
ctctatggag
acttcttcac
gggtgatgcc
*******核酸序列
，数字可以没有******
》AK076156.1
**********同上********
1
gcagcctggg
tcctcaccgt
cgccatggct
ccgtaccgct
cttcactgct
ctgcgcgctg
61
ctcctcctgg
cgctgtgcgc
actgtcgcct
tcccatgcag
ccaccacatc
acggggcagg
121
gcccaagaga
gggcgcccca
aagtcgggtg
tctgaggcgc
ggcccagcac
tatggtggtg
181
gagcaccccg
aattcctgaa
ggcagggaag
gagcctggcc
tgcagatctg
gcgtgtggag
241
aagtttgacc
tggtgcctgt
gccccccaac
ctctatggag
acttcttcac
gggtgatgcc
******同上******
以上为示例，*************中间的字不要
clustalw linux怎么操作
Linux_clustalW安装及使用
首先解压压缩包
tar -xzvf clustalw-2.1.tar.gz
进到解压后的文件夹
cd clustalw-2.1
安装
./configure
make
进到下面这个文件夹
cd src/
运行即可
./clustalw2
用clustalW建树
运行clustalW，先按1回车
附上fa文件的完整路径（建议）回车
按2回车
再按一次2回车
等待，完了之后，会让输入输出完整路径。
接着就可以退出clustalW了（按x）。
***隐藏网址***
clustalw clustalx有什么区别啊
clustalX是clustaw的图形化版本，前者在windows环境下使用，后者在DOS环境下是使用。
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